Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms