Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc55Q3UY51 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc55Q3UY51 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc55Q3UY51 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms