Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWR2

Khdc1a, KH homology domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1aQ3UWR2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Khdc1aQ3UWR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Khdc1aQ3UWR2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Khdc1aQ3UWR2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms