Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUF8

Ankrd34b, Ankyrin repeat domain-containing protein 34B, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34bQ3UUF8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34bQ3UUF8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34bQ3UUF8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd34bQ3UUF8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms