Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm29609Q3UU56 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm29609Q3UU56 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm29609Q3UU56 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms