Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fchsd2Q3USJ8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fchsd2Q3USJ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fchsd2Q3USJ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fchsd2Q3USJ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms