Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm28047Q3US59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gm28047Q3US59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28047Q3US59 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms