Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp560Q3URI6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp560Q3URI6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp560Q3URI6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304 ms