Protein–RNA interactions for Protein: Q3URD2

Rprml, Reprimo-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmlQ3URD2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RprmlQ3URD2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RprmlQ3URD2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RprmlQ3URD2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms