Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem253Q3UNB8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmem253Q3UNB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tmem253Q3UNB8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem253Q3UNB8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem253Q3UNB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms