Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem241Q3UME2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem241Q3UME2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem241Q3UME2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem241Q3UME2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms