Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Arfgef3Q3UGY8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Arfgef3Q3UGY8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Arfgef3Q3UGY8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms