Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc10a4Q3UEZ8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc10a4Q3UEZ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc10a4Q3UEZ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc10a4Q3UEZ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.3 ms