Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Parp8Q3UD82 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Parp8Q3UD82 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Parp8Q3UD82 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Parp8Q3UD82 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms