Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtpbp6Q3U6U5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtpbp6Q3U6U5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gtpbp6Q3U6U5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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