Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6Q4

Pik3r6, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3r6Q3U6Q4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3r6Q3U6Q4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3r6Q3U6Q4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3r6Q3U6Q4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3r6Q3U6Q4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pik3r6Q3U6Q4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pik3r6Q3U6Q4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pik3r6Q3U6Q4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pik3r6Q3U6Q4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms