Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud5Q3U2S4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Otud5Q3U2S4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Otud5Q3U2S4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Otud5Q3U2S4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms