Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J4

Ddb1, DNA damage-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb1Q3U1J4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddb1Q3U1J4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddb1Q3U1J4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddb1Q3U1J4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddb1Q3U1J4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms