Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc9Q3U0M1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc9Q3U0M1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms