Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfyve27Q3TXX3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfyve27Q3TXX3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfyve27Q3TXX3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfyve27Q3TXX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms