Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trmt1Q3TX08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trmt1Q3TX08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trmt1Q3TX08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trmt1Q3TX08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms