Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxw18Q3TSA9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fbxw18Q3TSA9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fbxw18Q3TSA9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxw18Q3TSA9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms