Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc127Q3TC33 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc127Q3TC33 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc127Q3TC33 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms