Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Samd11Q1RNF8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samd11Q1RNF8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Samd11Q1RNF8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms