Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim71Q1PSW8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim71Q1PSW8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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