Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Gli2Q0VGT2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gli2Q0VGT2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Gli2Q0VGT2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms