Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp2b3Q0VF55 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Atp2b3Q0VF55 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp2b3Q0VF55 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms