Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab42Q0PD08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab42Q0PD08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab42Q0PD08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms