Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Vps8Q0P5W1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Vps8Q0P5W1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Vps8Q0P5W1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Vps8Q0P5W1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms