Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ebf1Q07802 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ebf1Q07802 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ebf1Q07802 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms