Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfe2Q07279 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nfe2Q07279 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nfe2Q07279 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nfe2Q07279 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms