Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox10Q04888 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox10Q04888 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sox10Q04888 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sox10Q04888 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 698.7 ms