Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox8Q04886 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Sox8Q04886 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sox8Q04886 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sox8Q04886 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms