Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcad1Q04692 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarcad1Q04692 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarcad1Q04692 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms