Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl7Q03366 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl7Q03366 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms