Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pax5Q02650 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax5Q02650 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax5Q02650 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms