Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd1Q02242 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdcd1Q02242 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdcd1Q02242 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms