Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RykQ01887 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RykQ01887 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RykQ01887 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RykQ01887 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RykQ01887 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RykQ01887 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RykQ01887 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RykQ01887 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RykQ01887 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RykQ01887 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RykQ01887 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RykQ01887 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RykQ01887 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RykQ01887 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RykQ01887 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RykQ01887 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RykQ01887 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RykQ01887 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RykQ01887 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RykQ01887 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RykQ01887 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RykQ01887 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RykQ01887 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RykQ01887 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RykQ01887 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RykQ01887 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RykQ01887 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RykQ01887 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RykQ01887 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RykQ01887 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RykQ01887 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RykQ01887 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RykQ01887 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RykQ01887 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RykQ01887 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RykQ01887 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RykQ01887 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RykQ01887 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RykQ01887 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RykQ01887 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RykQ01887 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RykQ01887 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RykQ01887 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RykQ01887 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RykQ01887 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RykQ01887 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RykQ01887 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RykQ01887 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RykQ01887 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RykQ01887 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RykQ01887 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RykQ01887 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RykQ01887 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RykQ01887 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RykQ01887 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RykQ01887 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RykQ01887 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RykQ01887 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RykQ01887 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RykQ01887 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RykQ01887 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RykQ01887 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RykQ01887 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RykQ01887 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RykQ01887 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RykQ01887 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RykQ01887 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RykQ01887 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RykQ01887 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RykQ01887 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RykQ01887 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RykQ01887 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RykQ01887 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RykQ01887 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RykQ01887 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RykQ01887 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RykQ01887 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RykQ01887 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RykQ01887 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms