Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd1Q01822 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd1Q01822 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd1Q01822 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms