Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mc1rQ01727 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mc1rQ01727 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mc1rQ01727 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mc1rQ01727 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms