Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp1Q01514 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp1Q01514 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbp1Q01514 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms