Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EgfrQ01279 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EgfrQ01279 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EgfrQ01279 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms