Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga4Q00651 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga4Q00651 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms