Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
F8a1Q00558 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
F8a1Q00558 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms