Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HmmrQ00547 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HmmrQ00547 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HmmrQ00547 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms