Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
AlkP97793 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
AlkP97793 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
AlkP97793 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
AlkP97793 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
AlkP97793 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
AlkP97793 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
AlkP97793 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
AlkP97793 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
AlkP97793 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
AlkP97793 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
AlkP97793 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
AlkP97793 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
AlkP97793 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
AlkP97793 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
AlkP97793 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
AlkP97793 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
AlkP97793 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
AlkP97793 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
AlkP97793 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
AlkP97793 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
AlkP97793 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
AlkP97793 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
AlkP97793 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
AlkP97793 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
AlkP97793 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
AlkP97793 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
AlkP97793 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
AlkP97793 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
AlkP97793 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
AlkP97793 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
AlkP97793 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
AlkP97793 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
AlkP97793 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
AlkP97793 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
AlkP97793 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
AlkP97793 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
AlkP97793 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
AlkP97793 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
AlkP97793 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
AlkP97793 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
AlkP97793 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
AlkP97793 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
AlkP97793 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
AlkP97793 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
AlkP97793 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
AlkP97793 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
AlkP97793 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
AlkP97793 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
AlkP97793 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
AlkP97793 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
AlkP97793 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
AlkP97793 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
AlkP97793 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
AlkP97793 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
AlkP97793 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
AlkP97793 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
AlkP97793 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
AlkP97793 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
AlkP97793 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
AlkP97793 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
AlkP97793 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
AlkP97793 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
AlkP97793 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
AlkP97793 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
AlkP97793 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
AlkP97793 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
AlkP97793 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
AlkP97793 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
AlkP97793 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
AlkP97793 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
AlkP97793 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
AlkP97793 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
AlkP97793 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
AlkP97793 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
AlkP97793 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
AlkP97793 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
AlkP97793 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
AlkP97793 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
AlkP97793 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
AlkP97793 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
AlkP97793 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
AlkP97793 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
AlkP97793 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
AlkP97793 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
AlkP97793 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
AlkP97793 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
AlkP97793 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
AlkP97793 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
AlkP97793 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
AlkP97793 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
AlkP97793 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms