Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tarbp2P97473 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tarbp2P97473 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tarbp2P97473 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms