Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Npas1P97459 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas1P97459 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas1P97459 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas1P97459 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas1P97459 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Npas1P97459 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas1P97459 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Npas1P97459 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms