Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LystP97412 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LystP97412 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LystP97412 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LystP97412 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LystP97412 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LystP97412 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LystP97412 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LystP97412 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LystP97412 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LystP97412 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LystP97412 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LystP97412 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LystP97412 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LystP97412 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LystP97412 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LystP97412 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LystP97412 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LystP97412 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LystP97412 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LystP97412 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LystP97412 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LystP97412 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LystP97412 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LystP97412 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LystP97412 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LystP97412 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LystP97412 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LystP97412 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LystP97412 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LystP97412 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LystP97412 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LystP97412 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LystP97412 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LystP97412 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LystP97412 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LystP97412 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LystP97412 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LystP97412 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LystP97412 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LystP97412 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LystP97412 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LystP97412 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LystP97412 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LystP97412 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LystP97412 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LystP97412 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LystP97412 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LystP97412 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LystP97412 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LystP97412 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LystP97412 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LystP97412 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LystP97412 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LystP97412 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms