Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp1b3P97370 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1b3P97370 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp1b3P97370 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1b3P97370 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms